Elektroforetická buňka pro sekvenování nukleových kyselin kombinuje vysoce účinnou strukturu pro přenos tepla a humanizovaný design ovládání, který splňuje požadavky na paralelní elektroforézu vzorků nukleových kyselin s vysokou propustností a je vhodný pro jemné rozlišení fragmentů DNA, jako je AFLP, polymorfismus délky amplifikovaných fragmentů, SSCP, polymorfismus konformace jednovláknové DNA, HA, denaturační gradientová elektroforéza a další experimenty.
Vlastnosti elektroforetické komory pro sekvenování nukleových kyselin
- Vysoce účinný systém odvodu tepla: Použití vysoce čisté elastické hliníkové desky, která po speciální úpravě umožňuje rychlý a rovnoměrný odvod tepla, čímž se zabrání jevu „smiley face“ proužků a zajistí se, že elektroforetické proužky budou rovné a jasné.
- Vysoká průchodnost: Lze synchronizovat elektroforézu až 96 vzorků PCR najednou, což je vhodné pro mikrotitrační destičky nebo odběr vzorků lancetou.
- Speciální design hřebenu ve tvaru žraločích zubů: optimalizovaná struktura žraločích zubů zabraňuje vzájemnému ovlivňování vzorků a zajišťuje jejich nezávislé oddělení. Přesné rozestupy hřebenu usnadňují rychlé přidávání vzorků a pozorování pruhů.
- Jednoduchá a pevná konstrukce: k dokončení utěsnění a instalace elektroforetické komory jsou potřeba pouze čtyři knoflíky, což šetří čas a práci.
- Energeticky úsporný a ekologický design: vyžaduje malé množství pufru, přesná struktura koloidu, eliminuje únik lepidla a kapaliny, snižuje provozní náklady.
- Bezpečnostní ochranný mechanismus: vybaven automatickou funkcí vypnutí při otevření krytu, což eliminuje provoz holého napájecího zdroje a zaručuje osobní bezpečnost uživatelů.
- Odnímatelná spodní část komory: pohyblivá spodní část komory a výstupní otvor pro snadné odstranění zbytkové kapaliny, pohodlná údržba, zvýšení čistoty laboratoře.
Hlavní výhody
- vysoké rozlišení pásma: jev „bez úsměvu“, vhodný pro migrační rychlost malých rozdílů v citlivých experimentech.
- Vysoká účinnost vzorkování: podpora použití automatizovaného zařízení, jako je vícekanálová pipeta, pro zlepšení konzistence vzorkování.
- Dobrá reprodukovatelnost výsledků: konstantní elektrické pole a tepelná stabilita zajišťují opakovatelnost každého experimentu a spolehlivost dat.
- silná přizpůsobivost: vhodný pro různé denaturační nebo nodenaturační elektroforetické experimenty, kompatibilní s polyakrylamidovými a agarózovými gely.
- nízká prahová hodnota provozu: vhodný pro výukové laboratoře, výzkumné instituce a personál provádějící klinické testy.
Princip fungování
Elektroforetická buňka pro sekvenování nukleových kyselin je založena na principu vertikální elektroforézy v polyakrylamidovém gelu, která způsobuje migraci a separaci DNA nebo RNA podle molekulární velikosti v gelovém médiu působením elektrického pole. Během procesu elektroforézy je teplo rychle odváděno z hliníkové zadní desky, aby se udržela rovnoměrná teplota gelu a zabránilo se odchylkám v separaci způsobeným teplotním gradientem. Po separaci jsou k dispozici metody detekce jako stříbrné barvení, fluorescenční značení, radiační autoradiografie a další.
Oblasti použití
- výzkum genetického polymorfismu: například AFLP, SSR atd. pro identifikaci kmenů, populační genetickou analýzu.
- Screening mutací: detekce mutací DNA bází nebo strukturálních variací pomocí SSCP, HA a dalších metod.
- Výzkum regulace genové exprese: například experiment DNase I Footprinting, který se používá k identifikaci míst vazby protein-DNA.
- Test degradace nukleových kyselin: podpora testů ribonukleázy a nukleázy pro analýzu procesu degradace RNA nebo aktivity nukleázy.
- Ověření molekulárního klonování: ověření velikosti a čistoty produktů PCR nebo enzymových sekcí.